Alice (Mia Wasikowska thủ vai) sẽ trở lại với xứ sở thần tiên sau nhiều năm thực hiện ước mơ nối nghiệp cha mình và chu du trên biển. Cô gặp lại những người bạn cũ, nhưng Mad Hatter – người bạn đồng hành của cô trong phần trước – đã gặp nạn. “Có những người bạn không thể bỏ mặc”, giọng nói của sâu bướm Absolem nhắc nhở, và Alice bắt đầu một cuộc hành trình mới để cứu Mad Hatter. Cô sẽ phải làm cách nào?